Vatten och makromolekyler
Vatten är ett i många hänseenden unikt medium, och dess
egenskaper är helt avgörande för hur biologiska makromolekyler
uppför sig. Proteiners 3D struktur kan t ex i grova drag beskrivas
med att de veckar ihop sig för att minimera den del av de hydrofoba
("feta") aminosyreresterna som exponeras för vatten. Detta exjobb
består i simulering och analys av ett protein eller annan biomolekyl
i vatten, och syftar till att beskriva just vattnets beteende i närheten
av makromolekylen.